官方目录期刊
《吉林大学学报（医学版）》
综合性医学学术期刊，主要报道医学科学研究的新理论、新方法与新技术，涵盖基础研究、临床研究、影像学、调查研究及综述等栏目。
吉林大学医学部期刊
7 种期刊神经病学
《中风与神经疾病杂志》
以脑血管病为主要方向，同时报道神经内外科疾病及临床各学科神经系统并发症。
肝胆胰疾病
《临床肝胆病杂志》
我国较早创办的肝胆病专业期刊，强调肝胆胰并重、内外科并重及临床与基础并重。
实验诊断与检验医学
《中国实验诊断学》
面向临床实验诊断学与检验医学，关注实验检查在临床医学中的应用、评价与研究进展。
老年医学
《国际老年医学杂志》
报道国内外老年医学领域研究成果与实用信息，主要刊载原著、综述及相关文献内容。
附属医院主办英文期刊
eGastroenterology
开放获取英文胃肠病学期刊。2026 年公布首个影响因子 10.5，现为 Web of Science 核心合集 ESCI 收录，严格口径下不等同于 SCIE。
附属医院承办期刊
《中华神经创伤外科电子杂志》
聚焦神经创伤外科临床与基础研究。该刊法定主办单位为中华医学会，吉林大学第一医院属于承办与依托单位。